Семинар Биоинформатика, 11. децембар 2015.

• 08. Децембар, 2015
• Коментари (0)

Наредни састанак Семинара биће одржан у петак, 11. децембра 2015. од 18:15 часова у сали БИМ Математичког факултета, IV спрат.

Предавач: проф. др Cenk Sahinalp из Центра за биоинформатичка истраживања Факултета за информатику и рачунарство у Блумингтону, у Индијани, САД.

Област научног интересовања проф. Sahinalp-а укључује биоинформатику, теоријско рачунарство и алгоритме.

Наслов предавања: "Data driven research in (cancer) genomics"

Апстракт: Sequencing projects involving thousands of individual genomes are underway and the need for algorithmic speedup is bigger than ever. We will go through some of the algorithmic developments introduced by my lab to address challenges in big data genomics, especially for cancer research. These algorithms involve one or more techniques in data compression, streaming, memory hierarchy awareness and parallelization. Application areas range from read mapping to variant calling, novel isoform and fusion gene identification to clonality inference.

Организатори семинара су проф. др Гордана Павловић-Лажетић, проф. др Бранко Драговић и проф. др Ненад Митић, руководилац семинара.