Семинар за вештачку интелигенцију, 29. новембар 2023.

• 22. Новембар, 2023
• Коментари (0)

Наредни састанак Семинара биће одржан онлајн у среду, 29. новембра 2023. са почетком у 19 часова.
 
Предавач: Биљана Стојановић, Математички институт САНУ
 
Наслов предавања: АНАЛИЗА ОБРАЗАЦА УПОТРЕБЕ КОДОНА У КОДИРАЈУЋИМ СЕКВЕНЦАМА ПРОТЕИНА ВИРУСА ФАМИЛИЈЕ КОРОНАВИРУСА
 
Апстракт:
У предавању ће бити представљени резултати анализе образаца употребе кодона у кодирајућим секвенцама протеина вируса фамилије коронавируса (енг. CoV): SARS-CoV-2, SARS-CoV-1, MERS-Cov, Bcov (Bovine coronavirus) и Bat-HKU3 (Bat coronavirus). Прикупљени материјал сардржи око 980.000 изолата вируса и преко 15.000.000 протеина. Каква је склоност вируса или њихових компоненти (гена) ка одређеним кодонима испитано је тако што су урађени кластеровање и класификација протеина вируса према обрасцима употребе кодона. Класификациони модел је направљен за препознавање врсте коронавируса на основу употребе кодона у протеинима вируса. Обрасци употребе кодона добијени су применом неких метода (мера) за израчунавање и евалуацију употребе кодона. Биће приказани резултати за две методе: Релативну употребу синонимних кодона (енг. Relative Synonymous Codon Usage, RSCU; Sharp, Li, 1986) и Ефективни број кодона (енг. Effective Number of Codons, ENC; Wright, 1990; Sun et al, 2013).
 
Напомена: Регистрациона форма за учешће на Семинару је доступна на линку:
https://miteam.mi.sanu.ac.rs/asset/CW5nJWDSEZDj7p32p

Уколико желите само да пратите предавање без могућности активног учешћа, пренос је доступан на линку:
https://miteam.mi.sanu.ac.rs/asset/4LNW8WtML7rLKojoz